В старом загране фамилия заканчивалась на -aya, в новом написание поменяли на -aia. Это надо отдельно указывать в K-ETA как прежнее имя?

В K-ETA основные данные должны точно совпадать с текущим паспортом. Если форма спрашивает прежние имена/другие варианты написания, укажите старую транслитерацию так, как она была в предыдущем документе. Если такого вопроса нет, не добавляйте информацию в случайные поля; при сомнениях используйте официальный Ask Us K-ETA.